En el Estado autonómico la auténtica cooperación intergubernamental se desarrolló durante largo tiempo al margen de los órganos institucionalizados. Fundamentalmente ésta se realizó en el ámbito político, mediante negociaciones entre las cúpulas de los principales partidos o en reuniones bilaterales del Presidente del Gobierno con el de cada Comunidad Autónoma. La cooperación mediante Conferencias intergubernamentales se limitó a cuestiones de alcance menor, siendo las Conferencias Sectoriales el principal instrumento. Tras la última ola reformadora del Estado de las Autonomías, se consagraron en los Estatutos reformados principios e instrumentos de cooperación y se institucionalizaron dos nuevas Conferencias intergubernamentales del máximo nivel: la Conferencia de Presidentes, en el ámbito vertical, y la Conferencia de los Gobiernos de las Comunidades Autónomas, en el horizontal. En este trabajo se analizan los resultados de la cooperación intergubernamental en España, especialmente la realizada a través de las nuevas conferencias intergubernamentales, así como los desafíos a superar para su consolidación.